Bắt đầu đào tạo tiến sĩ từ năm 1998 đến nay, trường hiện có 10 chuyên ngành đào tạo tiến sĩ là Nội tiết, Nội tim mạch, Nội tiêu hóa và Nội thận - Tiết niệu, Ngoại tiêu hóa, Sản Phụ khoa, Y tế công cộng, Chẩn đoán hình ảnh Ngoại tiết niệu và Nhi khoa. Hiện 116 nghiên cứu sinh đang học tập, nghiên cứu tại trường và 83 học viên đã tốt nghiệp.
*Chiều cùng ngày, Trường đại học Y Dược Huế tổ chức Lễ Tốt nghiệp và trao bằng Cao học, Bác sĩ nội trú, Chuyên khoa cấp II năm 2016. Khóa học 2014-2016 đào tạo Chuyên khoa cấp II có 54 học viên tốt nghiệp, trong đó hơn 74% tốt nghiệp loại giỏi, gần 26% tốt nghiệp loại khá. Khóa học 2013-2016 đào tạo Cao học có 53 học viên tốt nghiệp, trong đó gần 57% tốt nghiệp loại giỏi và hơn 43% tốt nghiệp loại khá. Về Bác sĩ nội trú có 72 học viên tốt nghiệp, trong đó gần 89% tốt nghiệp loại giỏi và hơn 11% tốt nghiệp loại khá.
Ngọc Hà