Năm học 2013-2014, Trường tiểu học Lý Thường Kiệt đón 1.004 học sinh vào học tại 26 lớp. Cô Phụng là Khối trưởng khối 1, giáo viên chủ nhiệm lớp 1/1. Theo nhận xét của bà Nguyễn Thị Thanh Bình, Hiệu trưởng nhà trường, cô Phụng là giáo viên có kinh nghiệm, có năng lực về chuyên môn, 4 năm liền đạt danh hiệu chiến sĩ thi đua cơ sở. Trong hoạt động đoàn thể, cô là người nhiệt huyết, đi đầu và nhận được sự tín nhiệm cao của tập thể. Hiện, cô Phụng là đảng viên, Chi ủy viên chi bộ nhà trường. Ngoài sự tín nhiệm trong trường, cô Phụng cũng rất được phụ huynh tin tưởng, gửi gắm con em theo học. Sĩ số học sinh lớp cô Phụng bao giờ cũng cao nhất khối. Sự việc mà đơn thư tố cáo cô Phụng đánh học sinh là không đúng, có tính chất vu khống. Về việc chuyển lớp học của học sinh là do sĩ số lớp cô Phụng quá cao, 42 cháu, trong khi đó, lớp học khác chỉ 38 cháu. Việc chuyển học sinh từ lớp này sang lớp khác là việc điều tiết sĩ số lớp học của nhà trường, không phải do cô Phụng đánh mà phụ huynh xin chuyển lớp như đơn đã nêu.
Liên quan đến vấn đề này, bà Tôn Nữ Thùy Trang, Hiệu phó và bà Lê Na, Chủ tịch Công đoàn nhà trường cũng xác nhận cô Phụng không đánh học sinh. Ngày 19-8 là ngày học đầu tiên, do phụ huynh học sinh không trang bị bộ đồ dùng học tập cho cháu Thục Đoan như đã thống nhất từ cuộc họp phụ huynh vào ngày 15 và 16/8 trước đó (bởi bộ đồ dùng này dễ học, dễ giảng dạy), nên cô Phụng đã gọi phụ huynh học sinh để thông báo. Sau đó, phụ huynh cháu Đoan đã mua bộ đồ dùng học tập khác và cháu Thục Đoan vào học bình thường. Sự việc là như vậy, không có chuyện cô giáo dùng hộp bút đánh vào đầu học sinh
Ông Phan Văn Khoa, phụ huynh cháu Thục Đoan khẳng định chắc chắn: “Hoàn toàn không có chuyện cô Phụng dùng hộp bút đánh lên đầu con tôi. Tôi cũng không xin chuyển lớp cho con mà do cô Hiệu trưởng động viên tôi chuyển con qua học lớp 1/4 để điều hòa sĩ số các lớp”. Như vậy, việc đơn thư nặc danh tố cáo cô Phụng đánh học sinh là không có cơ sở.